Współczesne badania dowodzą, że przewód pokarmowy funkcjonuje jako autonomiczna sieć neuronowa. Społeczność bakterii (mikrobiom) liczy biliony mikroorganizmów, które pozostają w stałej symbiozie ze środowiskiem wewnętrznym. To właśnie one syntetyzują najważniejsze neuroprzekaźniki, bezpośrednio wpływając na tło emocjonalne, jakość snu i zdolności poznawcze.
Oprócz regulacji nastroju, jelita stanowią główną linię obrony. Około 80% wszystkich komórek odpornościowych jest skoncentrowanych w błonie śluzowej przewodu pokarmowego. Gdy równowaga bakteryjna jest w normie, bariera ta bezbłędnie rozpoznaje i neutralizuje niepożądane czynniki. Jeśli jednak równowaga przesuwa się w stronę nieprzyjaznej flory, funkcje ochronne drastycznie słabną, otwierając drogę do gromadzenia się produktów przemiany materii.
