Enteraalne närvisüsteem sisaldab sadu miljoneid neuroneid ja vahetab pidevalt signaale kesknärvisüsteemiga. See ülikeeruline võrgustik on koduks triljonitele mikroorganismidele, mis moodustavad ainulaadse mikrobioomi. Nende bakterite kogum töötab väga aktiivse bioloogilise ökosüsteemina ööpäevaringselt.
Sõbraliku ja patogeense floora tasakaalust sõltub, kui tõhusalt omastatakse toidust toitaineid, kui kiiresti eemaldatakse jääkained ja kui kiiresti reageerib kaitsebarjäär välistele ohtudele. Umbes 70% kaitsekuludest asub just seedetrakti limaskestadel.
Selle hapra tasakaalu nihkumine käivitab negatiivsete reaktsioonide kaskaadi. Kui kasulikud bakterid surutakse alla agressiivsete keskkonnategurite, stressi või tasakaalustamata toitumise tõttu, võtavad nende koha kiiresti patogeenid, mis rikub barjäärifunktsiooni ja käivitab süsteemse mürgistuse protsessi.
