Le système nerveux entérique contient des centaines de millions de neurones et échange en permanence des signaux avec le système nerveux central. Ce réseau d'une grande complexité abrite des billions de micro-organismes formant un microbiome unique. L'ensemble de ces bactéries fonctionne comme un écosystème biologique hautement actif 24 heures sur 24, 7 jours sur 7.
C'est de l'équilibre entre la flore amicale et pathogène que dépend l'efficacité avec laquelle les nutriments des aliments sont assimilés, la rapidité avec laquelle les déchets métaboliques sont éliminés et la promptitude avec laquelle la barrière protectrice réagit aux menaces externes. Environ 70 % des cellules protectrices sont basées précisément dans les muqueuses du tractus gastro-intestinal.
Le déplacement de cet équilibre fragile déclenche une cascade de réactions négatives. Si les bactéries bénéfiques sont supprimées par des facteurs environnementaux agressifs, le stress ou une alimentation déséquilibrée, les agents pathogènes prennent rapidement leur place, perturbant la fonction de barrière et initiant le processus d'intoxication systémique.
