Az enterális idegrendszer több százmillió neuront tartalmaz, és folyamatosan jeleket cserél a központi idegrendszerrel. Ez a rendkívül összetett hálózat mikrobák billióinak ad otthont, amelyek egyedülálló mikrobiomot alkotnak. E baktériumok összessége rendkívül aktív biológiai ökoszisztémaként működik a nap 24 órájában.
A barátságos és patogén flóra egyensúlyától függ, hogy milyen hatékonyan szívódnak fel a tápanyagok az ételből, milyen gyorsan ürülnek ki a salakanyagok, és milyen gyorsan reagál a védőgát a külső fenyegetésekre. A védősejtek körülbelül 70%-a a gyomor-bél traktus nyálkahártyáján található.
Ennek a törékeny egyensúlynak a megbomlása negatív reakciók sorozatát indítja el. Ha a jótékony baktériumokat agresszív környezeti tényezők, stressz vagy kiegyensúlyozatlan táplálkozás elnyomja, a patogének gyorsan átveszik a helyüket, megzavarva a gátfunkciót és elindítva a szisztémás intoxikáció folyamatát.
